Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RIOK2Q9BVS4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RIOK2Q9BVS4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms