Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NUP58Q9BVL2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NUP58Q9BVL2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms