Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM62Q9BVG3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM62Q9BVG3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM62Q9BVG3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms