Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP25Q9BV90 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP25Q9BV90 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms