Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
VAMP8Q9BV40 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VAMP8Q9BV40 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms