Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPOQ9BU64 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms