Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NDC1Q9BTX1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NDC1Q9BTX1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms