Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HDHD3Q9BSH5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HDHD3Q9BSH5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms