Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAAF1Q9BRP4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms