Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDF4Q9BRK5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDF4Q9BRK5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SDF4Q9BRK5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms