Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
MESP1Q9BRJ9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms