Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
FYCO1Q9BQS8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
FYCO1Q9BQS8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FYCO1Q9BQS8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms