Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQJ4

TMEM47, Transmembrane protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM47Q9BQJ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM47Q9BQJ4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM47Q9BQJ4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms