Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PKP2Q99959 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKP2Q99959 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms