Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX2Q99697 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX2Q99697 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms