Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD5Q99666 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD5Q99666 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms