Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PHF12Q96QT6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PHF12Q96QT6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms