Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCNAQ96QF7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GCNAQ96QF7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms