Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMTK3Q96Q04 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
LMTK3Q96Q04 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMTK3Q96Q04 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms