Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRERF1Q96PN7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRERF1Q96PN7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms