Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NLRP3Q96P20 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NLRP3Q96P20 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms