Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CCDC115Q96NT0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CCDC115Q96NT0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms