Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM20AQ96MK3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM20AQ96MK3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM20AQ96MK3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms