Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF4

CCDC140, Coiled-coil domain-containing protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC140Q96MF4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC140Q96MF4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC140Q96MF4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms