Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP47Q96K76 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP47Q96K76 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms