Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
TPD52L3Q96J77 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TPD52L3Q96J77 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms