Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC34Q96HJ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC34Q96HJ3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms