Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CALML4Q96GE6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CALML4Q96GE6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms