Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IMP4Q96G21 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IMP4Q96G21 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms