Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RNFT2Q96EX2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RNFT2Q96EX2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms