Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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HDAC11Q96DB2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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HDAC11Q96DB2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC11Q96DB2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC11Q96DB2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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