Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RCN3Q96D15 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCN3Q96D15 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms