Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EXOSC8Q96B26 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EXOSC8Q96B26 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms