Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VTI1AQ96AJ9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VTI1AQ96AJ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VTI1AQ96AJ9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms