Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPS3Q969F9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPS3Q969F9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms