Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EDAQ92838 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EDAQ92838 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EDAQ92838 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EDAQ92838 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EDAQ92838 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDAQ92838 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDAQ92838 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EDAQ92838 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDAQ92838 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDAQ92838 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDAQ92838 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDAQ92838 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EDAQ92838 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EDAQ92838 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
EDAQ92838 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDAQ92838 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDAQ92838 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDAQ92838 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDAQ92838 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDAQ92838 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDAQ92838 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDAQ92838 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDAQ92838 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDAQ92838 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EDAQ92838 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms