Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PHF3Q92576 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PHF3Q92576 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms