Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113Q902F9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HERVK_113Q902F9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms