Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZA2

RAPGEF4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF4Q8WZA2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF4Q8WZA2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF4Q8WZA2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
RAPGEF4Q8WZA2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RAPGEF4Q8WZA2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms