Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DNAAF4Q8WXU2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DNAAF4Q8WXU2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DNAAF4Q8WXU2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms