Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GATAD2BQ8WXI9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GATAD2BQ8WXI9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GATAD2BQ8WXI9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GATAD2BQ8WXI9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GATAD2BQ8WXI9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GATAD2BQ8WXI9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GATAD2BQ8WXI9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms