Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CASKIN2Q8WXE0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CASKIN2Q8WXE0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms