Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY2Q8WXA3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY2Q8WXA3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms