Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
PALLDQ8WX93 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
PALLDQ8WX93 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PALLDQ8WX93 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms