Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LMO7Q8WWI1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LMO7Q8WWI1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms