Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC12Q8WVT3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC12Q8WVT3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms