Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSMCE1Q8WV22 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSMCE1Q8WV22 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms