Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PATJQ8NI35 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PATJQ8NI35 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms