Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPATA4Q8NEY3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA4Q8NEY3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms