Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF548Q8NEK5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF548Q8NEK5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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